Il Politecnico di Bari è organizzato in settori che concorrono al perseguimento degli obiettivi dell'Ateneo fornendo servizi amministrativi e tecnici che rispondono ad esigenze sia interne che esterne.
Per rendere la struttura organizzativa dell'Ateneo più rispondente alle nuove esigenze, è in corso una riorganizzazione dei settori, che favorisca lo sviluppo delle professionalità e il miglioramento dei servizi.